O Seminário São João XXIII, foi pensado por nosso bispo diocesano Dom Jesus Maria, no ano de 2017, o objetivo era criar um ambiente preparatório e introdutório para os Seminaristas da Diocese de Bragança, em acordo com a Ratio Fundamentalis Instituitionis Sacerdotalis.

O Seminário Maior São Paulo VI, teve seu terreno comprado em outubro de 1983, fruto de uma longa procura do então vigário geral da Diocese, Luigi Ferrando (Hoje bispo emérito da diocese). Após a aquisição do terreno, a casa teve que passar por algumas reformas e adaptações para abrigar os seminaristas diocesanos e somente em Março de 1984, começou a funcionar esta casa de formação presbiteral.